生态学，从宏观来看，是研究生物圈与地球本身的相互关系的生物科学。具体说，是研究生物与环境（有生命和无生命）的相互关系的学科。从这个意义上讲，微生态学，应该包括在生态学范畴内。但是，客观事物是由不同层次组成的，作为反映客观事物的科学也应该有不同层次。不同层次有总体的共同规律，也有层次特有的特殊规律。这种现象在其它科学，如物理学、化学、生物学等等方面都存在。

在物理学中的经典力学与量子力学是两个层次，前者主要反映宏观力学现象，后者反映微观力学现象。共性大于特性时，就是一个学科，特性大于共性时就要分化为两个学科。生态学也是一样，当宏观生态学与微观生态学的共性大于特性，就是一门学科，当特性大于共性时就必然分化为两个学科。

图：生态层次分化示意图

上图显示，不同的生态层次，其研究对象不同，其理论与方法也必然有很大差异，因而从宏观生态学分化出微观生态学或超微观生态学是必然规律。