植物内生菌（Plant    endophyte）是指那些在其生活史的一定阶段或全部阶段生活于健康植物的各种组织和器官内部的微生物，被感染的宿主植物（至少是暂时）不表现出外在病症，可通过组织学方法或从严格表面消毒的植物组织中分离或从植物组织内直接扩增出微生物DNA的方法来证明其内生。它不仅包括互惠共利的和中性的内共生微生物，也包括那些潜伏在宿主体内的病原微生物，这些微生物有细菌、真菌、放线菌等。自1898年Vogl从黑麦草种子内分离出第一株内生真菌以来，植物内生菌作为一种新的微生物资源受到了广泛的关注，从内生菌中寻找和发现新的活性化合物已成为国内外研究的又一热点。近年来，该领域的研究已取得一定进展，发现了一些有医用、农用价值的菌株和化合物。笔者将对具有农药活性的植物内生菌的研究进展作一综述。

一、植物内生菌的普遍存在性和生物多样性

内生菌普遍存在于各种陆生及水生植物中，具有分布广、种类多的特点。现已发现有80多个属的几百种禾本科植物都有与之共生的内生真菌。近二十年来，内生真菌在一些重要的经济林木如针叶类的各种冷杉、云杉、红杉、紫杉、松柏等以及阔叶的栎树、桦树、桤木、桉树等植物树皮、枝叶内相继被分离和鉴定。在多种灌木、草本植物、栽培作物、果树、苔藓和蕨类植物中也陆续发现了内生真菌或内生细菌。从目前研究来看，尚未发现没有分离到内生菌的植株，因此可以推断内生菌在植物体内是普遍存在的。

内生菌广泛分布于植物体的根、茎、叶、花、果实和种子等器官组织的细胞或细胞间隙中，其种类、数量、分布定植都因植物种类不同而异。Anorld等最近分析了巴拿马中部雨林中两种植物叶子中的内生真菌，结果发现分离自83个健康叶片的内生真菌可有多达418个形态学种。内生细菌也具有相似的生物多样性，目前在各种农作物及果树等经济作物中发现的内生细菌已超过129种，分别隶属于54个属。